יואב איתן נולד בארת ישראל. הוריו ברחו מגרמניה מאימת הנאצים וזכו להיות עם מייסדי קבוצת יבנה. את חינוכו קיבל בקבוצת יבנה. בוגר האוניברסיטה העברית בביולוגיה (B.Sc) ותואר PHD בגנטיקה. למד תורה בבית הוריו ובבית הספר, יחד עם לימוד מתמשך מרבני ישיבת "כרם דיבנה" לדורותיהם.